Dans le même temps, il a tenu à défendre son ancien mentor, Pep Guardiola. Depuis des années, l’entraîneur de Manchester City affronte une critique récurrente : il suranalyserait les grands matchs et chercherait à surprendre l’adversaire avec des schémas tactiques et des compositions d’équipe peu orthodoxes, une audace souvent sanctionnée par un échec.
Le débat était déjà vif à l’époque de son passage au Bayern Munich. En demi-finale retour de la Ligue des champions 2014 face au Real Madrid, il avait ainsi aligné un « double six » composé de Bastian Schweinsteiger et Toni Kroos, une décision présentée plus tard comme dictée par la pression des cadres. Au lieu d’inverser le déficit de l’aller (0-1), les Bavarois se sont fait contrer et ont sombré 0-4. « La plus grosse connerie que j’ai jamais faite en tant qu’entraîneur », s’est-il maudit après coup.
Deux ans plus tard, en demi-finale aller contre l’Atlético Madrid, il surprend à nouveau en laissant Thomas Müller et Franck Ribéry sur le banc pour lancer Juan Bernat. Le Bayern s’incline 0-1 et se fait à nouveau éliminer.
« J’ai joué sous les ordres de Pep. Ce n’est pas vrai qu’il change tout lors des matchs importants. Ce ne sont que des bêtises des médias. Quand on perd, on doit s’expliquer. Quand on gagne, on a raison », a déclaré Kompany au sujet de la réputation largement répandue de son modèle d’entraîneur catalan.